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如何让miRNA建库更高效、精准、便捷?

点击次数:1042 次    更新时间:2017-05-03

如何让miRNA建库更高效、精准、便捷?


如何让miRNA建库更高效、精准、便捷?


QIAGEN推出新一代miRNA二代测序建库产品QIAseq miRNA Library Kits,该系列miRNA建库产品基于特有的分子条形码(molecular
barcoding)技术,结合相应的数据分析解决方案,可实现在二代测序平台,如MiSeq、NextSeq及HiSeq等上的miRNA精准无偏倚定量分析。该方案的推出进一步强化了QIAGEN在包括miRNA在内的非编码RNA研究领域的Sample to Insight完整解决方案。

QIAseq miRNA Library Kits


► 适用于来自任何物种的诸如细胞、组织、FFPE以及血清血浆等多种类型样本;
► 最低的样本起始量要求仅为
1 ng总RNA。


此外,作为QIAGEN通用型NGS解决方案(Universal NGS Solution)中的重要一员,该产品还具有以下重要特点:

 

 分子条形码技术确保miRNA定量结果无偏差

 

QIAGEN已经成功将分子条形码(molecular barcoding)技术应用于基因突变、表达检测以及融合基因检测靶向测序Panel,而在最新推出的miRNA建库试剂盒中QIAGEN再次应用了此项突破性技术。
 

区别于传统的数据分析方法,通过对于测序结果中分析条形码种类而非数量的统计,避免了扩增过程中因扩增效率而引入的偏倚对于定量结果的影响,从而实现媲美定量PCR准确度的miRNA二代测序定量分析。
 

QIAseq miRNA Library Kit含有多种全面的质控设置,可用于监控接头连接、逆转录等多步反应的效率,这对于结果的准确性也提供了十分重要的保障。


 

 独特的“gel-free”操作流程,miRNA文库构建仅需数小时


QIAseq miRNA Library Kit颠覆了传统miRNA文库构建依赖于繁琐的割胶回收来获取miRNA特异性测序文库的过程。


它独特的寡核苷酸处理技术极大程度降低了文库构建过程中接头二聚体及其他“污染性”RNA(如rRNA)的存在,不仅提高了比对结果中miRNA reads的比例从而使得文库构建的效率极大提高,也免去了凝胶电泳、割胶以及回收等一系列的繁琐步骤,借助方便快捷的磁珠纯化便可快速完成文库构建。


优化的操作流程,仅需8小时即可完成测序前的所需全部建库过程,手工操作时间少于3小时。
 


 全面而完整的多级数据分析系统,完美解读实验结果


QIAseq miRNA Library Kit得到的测序原始数据,可以直接上传到QIGEN官网上专用的数据分析模块进行分析。


在这里,数据结果中的分子条形码首先将会被识别并计数,并对相应的miRNA序列进行比对,而这一点对于发现各个物种中全新的miRNA也同样适用;之后,相应的miRNA表达分析会在后续的分析模块中进行计算并将差异结果以多种不同的可视化形式而得以展现。


整体分析过程简单、快速,让没有生物信息学背景的用户也能迅速对于测序结果进行快速准确的分析,自动的图表生成功能使得实验结果的展现更加生动具体。
 

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